在市场经济体系中，反不正当竞争法与反垄断法作为重要的法律工具，共同维护着市场秩序和公平竞争环境。两者虽然在目标上都旨在保护市场竞争，但在具体适用范围、立法目的及执法方式等方面存在显著差异。

首先，从立法目的来看，反不正当竞争法主要针对企业间通过欺诈、虚假宣传等手段进行的不当竞争行为，其核心在于规范市场主体的行为，防止不公平竞争现象的发生。而反垄断法则侧重于预防和制止具有市场支配地位的企业滥用权力，排除或限制市场竞争，从而保障整个市场的活力与效率。

其次，在调整对象方面，反不正当竞争法关注的是微观层面的具体竞争行为，如商业贿赂、侵犯商业秘密等；而反垄断法则着眼于宏观层面的市场结构问题，比如企业合并是否会导致行业集中度过高，进而影响消费者利益。

再者，两者的执法主体也有所不同。通常情况下，反不正当竞争案件由市场监管部门负责查处；而对于涉嫌构成垄断的行为，则需要由专门设立的反垄断执法机构来进行调查处理。此外，在程序设置上，反垄断法往往涉及更为复杂的经济分析和技术评估过程。

尽管如此，二者并非完全独立运作，而是相互补充、相辅相成的关系。例如，在某些复杂案件中，可能存在同时违反两项法规的情形，这就要求执法人员能够灵活运用两种法律框架来全面解决问题。另外，随着全球经济一体化进程加快，各国纷纷加强了对跨境垄断行为的监管力度，这也促使反不正当竞争法与反垄断法之间建立起更加紧密的合作机制。

综上所述，反不正当竞争法与反垄断法虽各有侧重，但它们共同构成了现代市场经济法律体系的重要组成部分。只有将两者有机结合，才能更好地实现维护公平竞争、促进经济健康发展的最终目标。